第二天起床之后，小金将上品水之石和上品雷之石交给了小翠，以后她的卡咪龟进化为水箭龟和小磁怪进化为三合一磁怪的时候需要用到。
离开了史顿镇，小金和小智他们一起踏上了新的旅途。因为已经收集了6个徽章，所以大家都没有着急赶路，观看着沿途的风景，小智的皮卡丘都在他的背包上睡着了。
突然，一个坐在石头上的老爷爷喊住了他们，给他们吹奏了一曲轻快的歌曲，打算让人没想到是他会讨要报酬。
不过，善良的小翠从背包里拿出了一个饭团给老爷爷，老爷爷看了真的是饿了，三两下就吃完了。
看到老爷爷胸口的笛子，小金感觉有些熟悉，但是好像哪里忘记了什么。
不过，小金他们没有多留，又向前方走去。来到附近的小镇，小金他们发现镇上所有的店铺都没有食物或者蔬菜可卖。不过，因为小翠本来准备了小金和自己两人份的饭团，所有大家可以分着填一下肚子，但是完全不能吃饱。
最后，小金他们坐着公园的石凳上唉声叹气，刚刚那点食物只能塞牙缝，一会儿又饿了。不过这是小镇的镇长走了过来，询问发生了什么事。知道他们的情况后，就邀请到他家去吃饭。
在吃饭途中，小霞和小刚询问镇上发生了什么事，怎么所有卖食物和蔬菜的店都没东西卖。镇长解释，这里的河流因为干涸了，所以不管是粮食还是蔬菜都歉收了，有的甚至完全没有收成。所以镇上的居民本身的粮食只能勉强糊口，哪里还会拿出来卖？
吃完后，镇长带着小金他们来到了干涸的河流面前，小智作为精灵大陆的四有好少年决定帮助镇上了解河流干枯的原因，准备探访河水的上游。
沿着河流前进，小智他们发现一大片的荆棘林把河流堵死了。本来小智打算从荆棘丛中的空隙爬进去。但是小金阻止了小智鲁莽冒险的行为，告诉他怎么直接冲过去，会被荆棘刺伤或者划伤的，有些荆棘甚至是有毒的。
小金提醒大家不要忘记自己拥有神奇宝贝，小智的妙蛙种子可以使用飞叶快刀，小霞的宝石海星和海星星可以使用高速旋转，小金自己的大针蜂使用十字斩，这些都是可以用来劈开荆棘，打通一条人可以走的路。
就在大家都把需要的神奇宝贝叫出来时，小霞的可达鸭擅自跑了出来，荆棘刺了个正着。这是可达鸭出来自作自受，好搞笑啊。
不久，大家总算通过了危险的荆棘丛。
穿过灌木，小金他们发现了已经干涸的水潭，突然小智指着河湾边露出半边身体的神奇宝贝大叫，“你们看，那是什么？”
原来是卡比兽堵住了，泉水涌出的地方。小金这时也想起来了当初那个路边老爷爷胸口就是用来叫醒卡比兽的精灵之笛，但是现在回去找太慢了，而且不知道老爷爷是否还在那个地方。
小金想着应该还有其他方法可以叫醒或者挪开卡比兽。
现在，没办法了，只能叫醒卡比兽，大家开始试验各种方法。
首先是小智想用高音喇叭叫醒卡比兽，但是没效，其他不管用神奇宝贝球收服还是想要挪动平均体重在460kg以上的卡比兽，都没有用。
小智气愤地瞪着一边看热闹的小金，“小金，你在那边什么事也不做，你好意思吗？你也是吃了镇长家的食物，难道不应该为这件事出力吗？”
“我看你们的办法只是在做无用功而已，我上去也是一样，所以才不会像你们一样费力不讨好。”小金摆了摆手，又阻止想要继续说话的小智，“是不是问我有什么办法可以挪开卡比兽，是的我是有一个，但是光凭我一个人做不到，要是那群像跟屁虫一样的火箭队在就好了。当然还有就是找到那个当初吹精灵之笛的老爷爷，叫他过来，这是最简单的办法，但是找不到就没办法了。”
“刚刚我好像听到什么人喊我们的名字，既然你诚心诚意地发问了，那我就大发慈悲地告诉你，为了防止世界被破坏，为了守护世界的和平，贯彻爱与真实的邪恶，可爱又迷人的反派角色，武藏，小次郎，我们是穿梭在银河之间的火箭队，白洞，白色的明天在等着我们，就是这样，喵~~~~。”火箭队三人组跳出来，站在小金他们面前。
“有他们三个在，那挪开卡比兽就不是问题。”小金自信地说。
首先将绳子绑在卡比兽的四肢，然后让火箭队的热气球开始拉起绳子，“朵儿使用最大力量的念力。”现在的朵儿全力使用念力可以移动300kg的物体，大概是自身体重的6倍，如果能使用念力控制自身体重10倍重的物体，说明朵儿的力量就达到天王境界。
最后，卡比兽慢慢地被移开了，露出了卡比兽背后的泉水的源头。但是事情并没有解决，发现泉水的源头被荆棘堵住了。
看到这样的情况，小金一时也没有什么好办法，只有让神奇宝贝强行破开荆棘丛。不过这时，路边的老爷爷出现了，“这只卡比兽是我的神奇宝贝，叫醒卡比兽就让我来吧。这些荆棘本来是让卡比兽每过一段时间就吃掉的，但是这次我来到有些晚了，就被长得太快的荆棘挡住了路，无法过来叫醒卡比兽就导致情况变得更严重了。”
老爷爷拿出了精灵之笛吹奏起来，轻快的笛声响起，卡比兽终于从沉睡中醒来，开始吃起了荆棘，很快吃完了周围的荆棘，被堵住的泉眼疏通了，河水默默又开始恢复了。整个小镇将再次回复活力，无限的生机开遍整个大地。
最终，小金他们解决了镇上的河水问题，受到了镇长的热情招待。但是他们的旅程并没有结束，新的目标还在等着他们。