告别了霓虹镇，小金一行人来到了大傻谷这个地方。大傻谷是以大溪谷景色而闻名全世界的地方，与小金前世号称自由之国的科罗拉多大峡谷差不多。

    没想到，小金一行人会在这里碰上小智的宿敌小茂，原来小茂和其他人都是为了发掘大傻谷的神奇宝贝化石而来。

    于是小茂打算和小金、小智比赛谁先挖到神奇宝贝化石，然后就充满热情地在谷中挖掘起来，没几下就挖到了一块化石，小茂十分兴奋。但是小茂没想到的是在旁边的专家观察后得出了这是神奇宝贝大便化石的尴尬之语，小茂直接摔到在地，他的六个女朋友都快哭了。

    小金也想起来了，这里的什么地方。

    前世的记忆中大傻谷位于狩猎地带和红莲岛之间的大溪谷内，小智一行人赶到这里时，小智见到了小茂，从他那里得知这里发现了古代神奇宝贝的化石，便来这里挖掘。

    由于火箭队三人组设定炸弹的关系，为了不让炸弹爆炸，而在消灭导火索时坠入山谷的深处的地下洞窟，在那里小智见到了五只古代神奇宝贝。小

    智被古代神奇宝贝化石翼龙带上了天空，由于遭到攻击而愤怒的火恐龙进化成了喷火龙，由于胖丁的关系再加上喷火龙的帮助，小智才得以解救，化石翼龙也坠落洞窟内，洞窟的入口也坍塌了。

    为了保护它们，君莎小姐和小智决定说是由于胖丁的歌声而睡着做的一场梦，让大家远离这个很可能全谷塌陷的危险，让古代宝可梦们安睡。在这里，小智还意外发现了一颗蛋——波克比。

    所以现在跟着小智很危险，如果和小智他们从裂缝中摔下去，谁知道自己和小翠会因为什么变故导致发生不可控的异变。而且小智还有火箭队三人组可是怎么摔都不死的存在，但是小金和小翠可不行，那可会死的。

    告别了小智三人，小金假装也想到大傻谷底挖神奇宝贝化石，如果好运的话，还真有可能得到。而且在遥远的丰源、神奥、卡洛斯等地区，已经可以实现或者正在开发化石复活技术，如果能找到珍惜的神奇宝贝化石，可以等到小金去其他地区旅行时，让化石复活，那么小金也可以得到珍稀的神奇宝贝。

    果不其然，很快不远处传来巨大的爆炸声，紧接着地面也发生了颤动。小金很快向着事发地点跑去，果然听小刚解释小智很可能已经掉到地下的石窟中去了。石窟的上方被大量的岩石掩盖，小刚和小霞连忙跑上去搬运着石头，但是他们发现这些碎石随时可能有崩塌的危险。

    小金让他们先上来，“朵儿，使用最强大的念力。”

    小金也使用念力，两人同时使用念力搬运着石头，朵儿每次可以移动200~300kg的石头，而小金可以移动50-100kg的石头，很快塌陷的石窟被开出了一个大洞，但是洞穴很深，黑漆漆的完全无法看清里面有什么东西。

    就在什么的人无比担心时，小智和火箭队先是被镰刀盔等追击，后来被化石翼龙捕食追杀，好在火恐龙终于有了战斗意志，挡住了化石翼龙的袭击。

    这时，小霞对着洞口大喊小智的名字，小智也回应了她，但是不幸的是小智在紧要关头被化石翼龙抓住了，而且飞出了洞口。

    化石翼龙看样子想要吃了小智，火恐龙发出火焰，想要挑战化石翼龙，化石翼龙反而扮鬼脸调戏火恐龙不会飞，完全打不到自己。火恐龙十分生气，直接进化成了喷火龙。

    于是两条龙开始了空战，但是喷火龙的速度完全跟不上化石翼龙，喷出的火焰不是没有命中化石翼龙，就是命中小智，小智现在都快被烤熟了。

    突然小霞提出了一个想法，让胖丁唱歌，让化石翼龙睡着，但是小霞没想到小智也在空中，化石翼龙一睡着就会掉下来。

    但是现在也没有什么好办法，小翠还是让胖丁出来唱歌了，于是化石翼龙和所有人都开始打哈欠，不一会全都睡着了。喷火龙紧要关头还是靠得住，堵住了耳朵，比其他人坚持久一些，救出小智，安全降落地面后，才睡着。

    不过现场还有一个人没睡着，就是小金趁着大家睡着紧随着跳入了化石翼龙坠落的洞口，换了一身火箭队暗部代号魁首的装扮，来到了石窟中。

    化石翼龙坠落地面的振动让洞口再次被掩盖起来。不过小金知道听了胖丁的歌声，其他人至少会睡一夜，大概有十几个小时，小金可以自由支配，不会让人发现自己从众人中消失。

    来到了地下洞窟，小金首先使用火箭队的特质精灵球将化石翼龙收服，从背包里拿出了火箭队的制服，穿上制服，带上假面，然后找到了被现在还存活的化石神奇宝贝围住的火箭队三人组。

    小金派出刚刚收服的化石翼龙，其他的化石神奇宝贝都表示臣服，因为这只化石翼龙本来就是他们的老大。于是小金轻轻松松就收服镰刀盔、菊石兽、多刺菊石兽和化石盔各两只。

    这些化石神奇宝贝可是非常值钱的，因为存世量非常稀少，所以市面上研究所、黑市、收藏家都会有需求。

    向火箭队三人组出示自己是火箭队中级干部魁首的证明后，三个人都跪在魁首面前，表示感谢救命之恩。

    小金也对火箭队三人提出了要求，这次的化石神奇宝贝上交总部后，自己会给他们三人一份功劳。但是以后他们必须在魁首需要的时候，听从魁首的命令。火箭队三人毫不犹豫地点头表示同意。

    魁首并没有马上离开洞口，而是和火箭队一行人大致探索了整个洞窟，了解到这里的确存在一些古代的神奇宝贝化石，虽然数量不多，但是这里的地址有也可以卖出去。小金就让火箭队三人拿了一个化石样品作为证据，之后直接带着他们从洞窟的另一个出口，来到了大傻谷的外围，然后火箭队三人在这里等待，自己和坂木正雄联系。